一般有三種病因，一是泌尿系感染，二是泌尿系結石，三是泌尿系腫瘤。
泌尿系感染可以通過患者癥狀以及尿常規檢查來判斷。如果存在尿頻、尿急、尿痛等急性膀胱炎發作癥狀，和尿常規發現紅細胞增高、白細胞增高，那么，確定泌尿系感染之后，使用抗生素進行治療。血尿消失，是由感染引起，那么感染控制之后，血尿自然消失。
如果是泌尿系結石引起，可能同時會伴隨感染，而泌尿系結石，如腎結石和輸尿管結石，由于結石在體內的活動可以刺激到腎臟和輸尿管黏膜，引起黏膜充血，表面毛細血管破裂，紅細胞進入泌尿系統尿液當中，從而導致肉眼血尿或者鏡下血尿的發生。因此，治療結石是根本，可以通過藥物保守或者體外沖擊波，以及手術治療。結石解除，血尿也自然消失。
而對于泌尿系腫瘤，則需要萬分慎重、小心，因為腫瘤引起的無痛性肉眼血尿患者，有時并不在意，以為是良性感染或者結石導致，因此，一定要進行進一步檢查，如泌尿系彩超、ct，甚至膀胱鏡的檢查，以確定膀胱內是否有膀胱腫瘤的發生。
如果膀胱腫瘤早期，可以進行TURBT，也就是經尿道膀胱腫瘤電切術，復發率較高，但是對人體早期治愈率也較高，特別對于淺表性的膀胱癌，可以通過電切來進行治愈。而對于基層淺表性膀胱癌，則預后大大降低。因此，一定不要放松血尿的的警惕，以排除腫瘤的診斷。
