再生障礙性貧血可的鑒別診斷主要有以下幾類疾病：
1、陣發(fā)性睡眠性血紅蛋白尿癥（PNH）這類疾病出血、感染均較少、較輕，網(wǎng)織紅細胞絕對值大于正常，骨髓多增生活躍，幼紅細胞增生較明顯，該克隆細胞的酸溶血試驗（Ham）和蛇毒試驗（CoF）多陽性。
2、骨髓增生異常綜合征（MDS）以病態(tài)造血為特征，外周血常顯示紅細胞大小不均，易見巨大紅細胞及有核紅細胞、單核細胞增多，可見幼稚粒細胞和畸形血小板。
3、急性造血功能停滯常由感染和藥物引起兒童與營養(yǎng)不良有關起病多伴高熱，貧血重，進展快，多誤診為急性再障。
4、骨髓纖維化（MF）慢性病例常有脾大，外周血可見幼稚粒細胞和有核紅細胞，骨髓穿刺多次干抽，骨髓活檢顯示膠原纖維和（或）網(wǎng)狀纖維明顯增生。
5、急性白血病（AL）特別是低增生性AL可呈慢性過程，肝、脾、淋巴結腫大，外周血全血細胞減少，骨髓增生減低，易與再障混淆。骨髓活檢也有助于明確診斷。
6、惡性組織細胞病（MH）常伴有非感染性高熱，進行性衰竭，肝、脾、淋巴結腫大，黃疸、出血較重，外周血全血細胞明顯減少，可見異常組織細胞。多部位骨髓檢查可找到異常組織細胞，常有吞噬現(xiàn)象。
