發燒傷39度5是指發熱39.5℃。小兒注射疫苗后發熱39.5℃，可能是由于疫苗反應、病毒性感冒、急性胃腸炎等因素導致，可通過物理方法、口服藥物的方式治療。
1、疫苗反應：
小兒在注射疫苗后，疫苗成分會對免疫系統造成刺激，使其產生相應的抗體，在此時就會引起發熱癥狀，這屬于疫苗后的正常不良反應，可遵醫囑服用布洛芬混懸液、布洛芬顆粒、對乙酰氨基酚口服溶液等退熱藥物治療，可有效的緩解癥狀。
2、病毒性感冒：
小兒在注射疫苗后，身體的免疫功能會下降，如果此時受到病毒感染，就會導致上呼吸道黏膜受到刺激，形成炎癥病變。當病毒通過血液循環對體溫調節中樞造成刺激時，會使其功能出現障礙，引起發熱的情況。可使用毛巾蘸取溫水對小兒的額頭、腋下等部位擦拭，可達到物理降溫效果。同時并遵醫囑服用磷酸奧司他韋顆粒、利巴韋林顆粒、鹽酸伐昔洛韋顆粒等抗病毒藥物，可抑制體內病毒，控制病情。
3、急性胃腸炎：
若小兒在注射疫苗后，進食了生冷或變質的食物，會導致胃腸道黏膜受到刺激，從而形成炎癥性感染，引起發熱、腹瀉、嘔吐等癥狀。可遵醫囑服用頭孢克肟顆粒、阿莫西林顆粒、羅紅霉素顆粒等抗生素藥物治療，可有效的減輕炎癥，緩解病情。
除上述原因外，還有可能是因為肺炎等原因引起，應及時就醫，完善檢查，配合醫生給予正確的治療。
